微生物主要以以下四种方式参与腐蚀过程。
（1）微生物新陈代谢产物的腐蚀作用，腐蚀性代谢产物包括无机酸、有机酸、硫化物、氨等，它们能增加环境的腐蚀性。
（2）促进了腐蚀的电极反应动力学过程，如硫酸盐还原菌的存在能促进金属腐蚀的阴极去极化过程。
（3）改变了金属周围环境的氧浓度、含盐度、酸度等，从而形成了氧浓差等局部腐蚀电池。
（4）破坏保护性覆盖层或缓蚀剂的稳定性，例如，管道有机纤维覆盖层被分解破坏，亚硝酸盐缓蚀剂因细菌作用而氧化等。