抗甲状腺药物主要有丙硫氧嘧啶和甲巯咪唑等。它们都能通过胎盘，都可以影响到胎儿。丙硫氧嘧啶与甲巯咪唑比较，丙硫氧嘧啶通过胎盘速度慢。准妈妈使用甲巯咪唑治疗，曾有致胎儿畸形的报道，主要畸形是头皮缺损，因此丙硫氧嘧啶为首选。每次应用丙硫氧嘧啶≤100毫克，每日3次，3～4周后方可逐渐控制住甲亢症状，因为丙硫氧嘧啶不影响碘的摄取，也不影响已合成的激素释放，需等体内储存的甲状腺激素适当消耗后才能显效。在此期间，应密切观察病情变化，包括安静时的脉率、脉压、多动表现、震颤、食欲及精神上的改变等。如果临床症状有改善，1个月后复查甲状腺功能，当血清T ₄值开始下降，丙硫氧嘧啶逐渐减少用量，如每次25～50毫克，每日3～4次，在妊娠末期，复查甲状腺功能，将其维持在正常准妈妈甲状腺功能的高值，才考虑停药。