关于作者

余光创,生物信息学教授,在香港大学公共卫生学院获得博士学位,现任南方医科大学生物信息学系系主任。作为一位活跃的R语言用户,他编写了许多R软件包,如aplot、badger、ChIPseeker、clusterProfiler、DOSE、emojifont、enrichplot、ggbreak、ggfun、ggimage、ggplotify、ggtree、GOSemSim、hexSticker、meme、meshes、nCov2019、plotbb、ReactomePA、scatterpie、seqmagick、seqcombo、shadowtext、tidytree及treeio,同时指导学生开发了一系列R软件包,如ggmsa、ggtreeExtra、MicrobiomeProfiler及MicrobiotaProcess等。

他的课题组旨在通过开发新的软件工具和对生物医学数据的新分析,对人类健康及疾病产生新的见解。他的课题组开发的软件包能够帮助生物学家分析数据,并揭示隐藏在数据之中的生物学线索。

余光创发表了多篇期刊论文,包括5篇高被引论文[1-5],被引用超过了10000次。其关于ggtree的论文[1]被选为专题文章[1],以庆祝Methods in Ecology and Evolution期刊创刊10周年。他连续两年(2020年和2021年)入选生物医学工程领域中国高被引学者。

参考文献

[1]Yu G,Smith D K,Zhu H,et al.ggtree:an R package for visualization and annotation of phylogenetic trees with their covariates and other associated data[J].Methods in Ecology and Evolution,2016,8(1):28-36.

[2]Yu G,Wang L,Han Y,et al.clusterProfiler:an R package for comparing biological themes among gene clusters[J].OMICS:A Journal of Integrative Biology,2012,16(5):284-287.

[3]Yu G,Wang L,He Q.ChIPseeker:an R/Bioconductor package for ChIP peak annotation,comparison and visualization[J].Bioinformatics,2015,31(14):2382-2383.

[4]Yu G,Wang L,Yan G,et al.DOSE:an R/Bioconductor package for disease ontology semantic and enrichment analysis[J].Bioinformatics,2015,31(4):608-609.

[5]Yu G H Q Y.ReactomePA:an R/Bioconductor package for reactome pathway analysis and visualization.[J].Molecular BioSystems,2016,12(2):477-479.


[1]10周年第八卷:多变量数据与系统发育树可视化/详情参见“外链资源”文档中关于作者第1条