月黑风高的夜晚，一女子本将客人送出门，意外看到胭脂巷外诡异一幕，于是将花妈妈叫出来一同查看，意外看到一个孤零零的轿子停在巷子中，而采薇身坐其中，不知生死。
宋公子捧着一束鲜花前来，想要追求自认为是青梅竹马、门当户对的林一曼，林一曼表示自己非常讨厌被当成联姻工具，而她的职业也不是宋公子认为的医生，而是法医。得知女方工作整日和尸体打交道，已经让宋公子害怕不已，眼见对方如此，林一曼随后开车离去。
林家镇，一位男童好奇追赶一只兔子，而奔跑的兔子却意外被路上车子碾压，随后男童带着兔子来找到裁缝爷沈小寒帮忙，沈小寒将碾压的兔子伤口缝合，让对方带着兔子尸体离开安葬。警员陈得力目睹沈小寒缝合完兔子尸体后才告知他胭脂巷死人了，而死的人是城隍奶奶。沈小寒跟着陈得力来到胭脂巷，意外见到省城来的法医林一曼，沈小寒并未过多关注这位外地来的法医，而是前去查看尸体。
花妈妈告诉警员，采薇三更天出门接待恩客，四更天被人发现回来已经没有呼吸。花妈妈不知道恩客具体是谁，但也怀疑此事和城隍爷有关。三天前，采薇和伙伴去城隍庙祈福，而祈福那会神像睁开眼了。民间有半盏莲花开神眼的说法，就是被城隍爷看上的姑娘所上的香会开成莲花状，而神像也会睁眼。次日采薇离开胭脂巷再回来就成如今模样了，花妈妈猜测不会恩客就是城隍爷吧。
林一曼认为尸体表面没有伤痕，需要进一步化验才能确认死因。随后警员将死尸带来药王庙，林一曼也赶来准备验尸，沈小寒认为人死后都是为了留有全尸，没听过死后要动刀子的，可林一曼却认为不动刀怎么知道死因。沈小寒表示尸体进了药王庙，就要守药王庙的规矩，两人互不相让。沈小寒私下警告林一曼，表示自己知道她压根不是省城专员，让她不要给自己添乱。
沈小寒思索采薇死因，百思不得其解，索性半夜前来查看尸体，却意外发现采薇“复活”。
林一曼在警局也分析采薇死因，采薇房间各种贵重物品都是从恩客手中而来，这些东西不可能是城隍爷所赠，而林一曼也发现采薇绣了部分绣品，必然是用来送人的。
周家少爷肺痨严重严重，常年卧病在床，这日又被少奶奶逼着喝下汤药，还以身体病弱阻拦周少爷出门，可周少爷对此也无能无力，只能看着对方将自己锁在家中。次日，陈得力也告知林一曼周家情况，因为周少爷常年卧病在床，周家生意常年都是少奶奶打理，而周家少奶奶比周少爷大八岁，是以童养媳的身份进入的周家。陈得力带着林一曼拜访周家，因为采薇房间的香囊上绣着一个周字，他们来此也是例行询问。周少奶奶表示当天周少爷犯了热病，刚好请了大夫医治，并表示他们夫妻并不认识什么胭脂巷的女人。周少奶奶表示自己可以配合调查案件，但如果故意玷污周家名声，无论是谁，周家商会都不会放过对方。
因为知道周家黑白通吃，陈得力也只好带着林一曼离开周家。两人离开后，周少爷现身质问周少奶奶，采薇到底是如何死的，周少奶奶却表示无论周少爷如何，在周家他始终是大少爷，而她永远是少奶奶，至于胭脂巷的女人和周家没有任何关系。周少爷却表示如果采薇真的死了，他宁愿陪采薇去死，也不愿见到周少奶奶。
陈得力带着林一曼去询问给周家少爷治病的大夫，大夫确认他当天三更天确实去周家给周少爷看病，也能作证周家少爷和少奶奶都在家中。虽然大夫排除了周家的作案时间，可林一曼始终觉得采薇的死亡时间和周少爷的犯病时间过于巧合，或许等沈小寒师父回来可以再继续调查。
沈小寒梦到采薇“复活”才从梦中惊醒，而花妈妈也来药王庙接采薇去城隍庙和城隍爷成亲，这让沈小寒也很意外。也在此时，沈小寒意外发现放置采薇棺材的房间有人进去过，而采薇尸体也消失不见。沈小寒的师父沈老拐终于归来，听闻了尸体不见，也只是责怪沈小寒睡觉太沉竟然两人进入药王庙都不知道。通过观察，沈老拐告诉众人，偷尸的人身体不太硬朗，余下之事，让沈小寒去处理，毕竟是因为他的失误导致尸体丢失。