1937年11月底，中国首都南京上空战云密布，城外日军炮声隆隆，古城欲摧，居民的命运扑朔迷离。
面对日军的强势推进，无能的国党政府机关纷纷撤离，下关码头人声鼎沸，混乱不堪。
作为国党情报特工机构的中统特工总部也急急忙忙收拾准备离开，但其工作性质又不允许一走了之，于是在撤退之前匆忙设立了一个南京留守处，由其四名骨干留守负责，带领手下人潜伏下来进行情报和破坏、暗杀行动。
淞沪会战的溃败，让这座古城成为日军的下一个目标，一时间城内外谍影重重，各方明暗势力蠢蠢欲动，局势变得波谲云诡。
特高课安插在南京各部门各行业那些处于休眠状态的特务开始苏醒，他们利用特殊身份，专门刺杀一些积极抗战的将领和爱国进步人士，尽其所能地破坏南京城内军民的抵抗信心。
伪满洲国成立后一直得不到国际社会和南京的认可，他们怨恨在心。大战在即，伪满汉奸们借机进入古城，威逼、利诱各种左右摇摆不定的人和势力为日本人卖命，他们四处发表消极抗战言论，蛊惑人心，动摇军心，妄图加速南京的失守。
在此民族危亡之际，红党再一次义无反顾地站了出来，派出骨干党员组成地下锄奸队，严惩那些想要投诚卖国和已经落水的狗汉奸。
在这些复杂的势力中，红党的实力最弱处境也最艰难危险，他们是特高课和伪满汉奸的眼中钉肉中刺，而表面上同意合作的国党，暗地里依然对红党痛下杀手。
两党合作后，沈醉曾亲示戴笠，过去以抓“汉奸”名义捕来的红党嫌疑人如何处理？今后是否继续反红党？
戴笠说，之前抓的秘密处决。现在我们的工作不仅仅是抓红党，但这项工作也不能全部放下。
这一回答，表现出国党对红党的最真实态度。