救治工作如火如荼的进行，李云龙突然接到通知，由于当前国内疫情灾害严重，经济形势困难，中央明确病毒来源目前尚未查明。李云龙无论如何也想不通，卫国和文婷也为此伤心难过。
钟亮得知仍未查明病毒来源的消息不顾病体赶回医疗队，他表示再坚持一下，病原体是可以找到的，然而一切已无法挽回。几个月，医院已成为他们生命的一部分，众人在医院门口相拥而泣，此情此景，令天地为之动容。同志们依依不舍的告别这片他们为之洒汗流血的土地。医院被隔离封了起来，李云龙告诉大家相信要不了多久，病毒传染的根源一定会找到。
工程局成立了疫苗研究所，李云龙担任书记，钟亮、卫国和文婷开始进行疫苗的研究。卫国和文婷去看望满满和佩奇的儿子念奇，数月间，满满心里一直念着佩奇，也牵动了文婷思念肖然的心弦。
兰娟终于怀孕了，李云龙乐得合不拢嘴，高兴的找钟亮喝酒。李云龙顺便请钟亮帮忙撮合卫国和文婷的事，钟亮有些为难。
刚盖起来的研究站因为施工简陋，文婷让卫国立即拆掉重建。卫国指责文婷设计不合理，让大家白白辛苦了一个月，文婷解释说实验失败是正常情况，二人不欢而散。李云龙严厉喝斥了卫国，他说卫国是在跟一个死去的人较劲，卫国一声不响地带人把房子拆了。
兰娟向李云龙主动要求代替文婷到各大市场采集数据，让文婷和卫国好好缓和一下，她劝解文婷把对肖然的思念珍藏在心底，从过去的阴霾中走出来，给自己一个幸福的机会，文婷心中似乎燃起了希望的光。
钟亮向李云龙汇报疫苗研究方案，李云龙丈二和尚听不明白，让钟亮干脆直接提出需要，他一定全力配合，心丹无奈的笑笑。
李云龙把卫国叫到帐篷内，猛给他灌了一瓶酒，让他现在就跟文婷说想娶她做老婆，卫国又惊又怯。李云龙激他如果完不成任务就是个窝囊蛋，卫国鼓起勇气向文婷帐篷走去。
文婷看到卫国冒失的闯进来，刚要发火，卫国不由分说一口气把对文婷的感情对她的歉意一股脑说了出来。看着卫国笨嘴拙舌但发自肺腑的一番话，文婷被彻底打动了，终于说出“愿意”两个字，两人幸福相拥在一起。
卫国和文婷在雷神山上举行了简朴而热闹的婚礼，李云龙高兴的让张大彪给兰娟打电话，把这个喜讯告诉她。兰娟接到电话一兴奋不小心跌下山坡。