因部分机化性肺炎的临床及影像表现类似常见的“感染性肺炎”，故通常大部分的患者在确诊前均经过了广谱的抗感染，甚至抗真菌、抗结核治疗，但临床无明显好转或影像学提示肺内病变无明显吸收，甚至继续进展。当除外感染相关性疾病后，根据病史特点、临床症状、化验检查、肺功能检查及CT影像学等可作出初步诊断，但确定诊断仍需活检病理，如经支气管肺活检、经皮肺穿刺以及外科肺活检等。