在妊娠期必须治疗甲状腺功能亢进症，丙硫氧嘧啶（PTU）是妊娠期（尤其是孕早期）首选的甲状腺拮抗剂，次选甲巯咪唑（他巴唑）和卡比马唑（甲亢平）。约10%患者可能出现一过性白细胞减少症，不需要停药。但约有0.2%患者出现突发性粒细胞缺乏症，需要停药。丙硫氧嘧啶可以部分阻止T ₄转化为T ₃，不易通过胎盘屏障，不会引起皮肤发育不全，通常剂量是从300～450毫克/日开始。治疗标准是使用最小的剂量来保持准妈妈甲状腺功能略高于正常水平。甲状腺拮抗疗法不应当结合甲状腺素补充剂，否则会增加母体对甲状腺拮抗剂的需求量。由于甲状腺拮抗剂可能会导致胎儿甲状腺功能减退，同时格雷夫斯病的自身抗体经胎盘转移会导致甲状腺功能减退，所以应该用超声扫描监测胎儿的甲状腺，并有必要对新生儿甲状腺参数进行测试。实验室参数临界边缘且症状轻微的甲状腺功能亢进，可以不用甲状腺拮抗剂，仅进行对症治疗（如β受体阻滞剂、普萘洛尔等）。孕早期使用甲巯咪唑或卡比马唑可能会发生罕见胚胎病，所以建议进行详细的超声波检测。一旦出现严重的甲状腺功能亢进症状，即使在妊娠期，也可以进行甲状腺切除术。严禁使用碘剂进行放射线治疗。